Ansat ved DJM i 1993 og siden 1996 som docent. Thomas Jensen er tilknyttet Sønderjyllands Symfoniorkester som solofløjtenist. Han har medvirket som solist ved adskillige koncerter rundt om i Europa, USA og Rusland og haft flere dirigentopgaver for landsdelsorkestrene i Aalborg, Aarhus, Odense samt RUO.